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利用“大數(shù)據(jù)”尋找腫瘤免疫治療的新方向

最近來自Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute(SBP)的研究人員發(fā)現(xiàn)了超過100個影響癌癥免疫應(yīng)答的新基因區(qū)域。這項發(fā)表在國際學(xué)術(shù)期刊Cancer Immunology Research上的最新研究將推動免疫療法的開發(fā),找到更多增強免疫系統(tǒng)殺傷腫瘤的新策略。

“通過對一個大型的公共基因組數(shù)據(jù)庫進行分析,我們發(fā)現(xiàn)了122個可能影響癌癥免疫應(yīng)答的基因區(qū)域,這些區(qū)域發(fā)生的基因突變與腫瘤組織中免疫細胞的存在與否有關(guān)。”文章作者Eduard Porta-Pardo博士這樣說道。他還表示,“其中許多基因區(qū)域?qū)槟[瘤免疫研究提供新的方向,有助于開發(fā)新的腫瘤免疫治療方法。”

目前多數(shù)腫瘤免疫治療都依賴一個類似的策略——解除對免疫系統(tǒng)的限制。如果免疫系統(tǒng)能夠?qū)⒛[瘤識別為威脅因素,那么這些治療方法將非常有效,但是一些癌癥仍然會通過至今未知的一些機制將免疫細胞阻擋在外。

文章高級作者Adam Godzik教授表示:“想要開發(fā)適用于多種癌癥的免疫療法,我們需要知道更多關(guān)于免疫系統(tǒng)如何與腫瘤發(fā)生相互作用的信息。而我們的研究恰好提供了許多新的方向。”

Porta-Pardo評論道:“基因突變會通過不同方式影響編碼蛋白功能,而這種功能的改變又依賴于蛋白質(zhì)突變發(fā)生的位置,基于這一事實我們能夠?qū)?dǎo)致癌癥的突變進行高精度鑒別。依據(jù)我們開發(fā)的新算法domainXplorer我們可以發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域突變與表型之間的關(guān)聯(lián)性,在這篇文章中就是蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域突變與腫瘤組織中免疫細胞浸潤數(shù)量之間的關(guān)聯(lián)性。”

這項工作表明開發(fā)數(shù)據(jù)具有非常重要的價值,研究人員可以從Cancer Genome Atlas中獲取病人腫瘤樣本的基因組數(shù)據(jù)直接進行分析,而不需要建立龐大的合作網(wǎng)絡(luò)來獲取大量組織樣本。他們計劃下一步使用算法尋找與腫瘤組織中特定免疫細胞類型有關(guān)的基因區(qū)域,這樣就可以揭示更多關(guān)于腫瘤免疫的詳細信息。(生物谷Bioon.com)

 

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