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新一代測序:影響的不只是醫療行業

          JPMorgan的醫療行業峰會都是傳統藥企唱絕對主角,生物科技類公司就是過來看有什么能得幫上忙。而今年,投資大佬們紛紛轉向數據分析,數字醫療,怎樣更好地服務患者等與新一代基因測序(NGS)技術相關的公司。

從Google風投人士參加行業會議的感受看行業變化

      過去三十年,JPMorgan(摩根大通公司,美國現代金融業“教父”)的醫療行業峰會都是傳統藥企唱絕對主角,生物科技類公司就是過來看有什么能得幫上忙。

而2014年1月16日的這次會議游戲規則有些不同。臺上活躍,臺下達成合作意向的都是些醫療保險公司,軟件開發商,數據分析商,以及各種IT類企業。

      “我來過5次了,以前全部是傳統藥企,談的都是怎么治療某種病。但隨著新醫改法案(AffordableCareAct)的頒布,出現了一些幾年前完全沒有的商業模式。現在大家談的都是數據分析,數字醫療,怎樣更好地服務患者。我們投的一家IT類公司之前問我,‘你覺得我應該去JPMorgan的會么’,5年前我會跟他說沒必要,但現在我跟他說,‘你真的應該去’。”

       醫改的方向之一是把醫院報銷額度與病人的治療效果聯系地更加緊密,而不是患者數量。這促使醫院等相關方購買軟件和大數據產品來進行跟蹤。“這些產品一直都在那,只是之前缺少激勵機制。現在要么做,要么沒得做。”

       JPMorgan會議來了一些新面孔,所有業內最好的醫療保險服務提供商。改變不會一夜之間發生,但誰都明白重大變化在醞釀,所以也許只是想離這些變化近一些。

       GoogleVentures投的相關公司包括基因分析公司FoundationMedicine(曾為喬布斯提供服務并被其大為贊賞),大數據公司DNANexus,以及消費類基因序列公司23andMe(其創始人同時為Google創始人之一布林之妻)。

細數新一代測序界的風云變幻

NO.1:時代周刊封面人物再度組建“人類長壽公司”

         2000年曾與當時與人類基因組計劃代表同時入選時代雜志封面人物鼻祖級人物CraigVenter2014年3月再度出山創辦HumanLongevityInc。

Venter這一次挑戰的是包括MIT與Harvard共同支持的Broad研究院在內的世界一流基因研究中心。公司第一輪籌得7000萬美元(預期撐過18個月沒問題的資金量),投資方包括全球最大基因測試設備提供商Illumina。這個邏輯不難理解,Illumina需要大量的研究來推動(基因測試)市場需求。

    “借助Illumina最先進的技術(Venter買入20臺HiSeqXTen),我們的目標是成為全球最大的人類基因測序中心”。這里的最先進技術,指的是今年年初Illumina公布的最強大測序儀HiSeqXTen。一套10臺,總價為1000萬美金,適合群體規模的測序項目,被解讀為首次讓1000美元基因組測序成為現實。

NO.2:Illumina公司訂單情況和市場反饋熱度超出預期

       根據Seekingalpha上Illumina今年1月28日業績交流會錄音,有分析師問到在當前沒有可抗衡的競爭對手的情況下,推出新產品出于怎樣考量。Illumina公司的CEO的表示:現在不僅是技術儲備到位,而且市場需求到位,所謂的需求是指公司一直判斷wholehuman基因測序是未來的方向,現在大規模的需求已經爆發,之前是受價格過高阻礙。

       Illumina公司CEO還透露目前公司產品訂單情況和市場反饋熱度超出預期。CEO還指出多年以來制約基因測序技術全面發展的問題是臨床樣本的利用率太低(10-15%),2500的技術條件下受制于價格因素很難實現大規模測序。現在這個平臺也許能夠讓大家把10-15年前沒有做或者想做的項目完成。

NO.3“人類長壽公司”高手云集

       Venter召集的肯定是各個領域的專家,基因組學,干細胞學,癌癥,轉化醫學,微生物學,以及各項新興技術領域的大牌專家。因為在Venter給自己制定的宏偉計劃中,這些領域都與公司未來的使命有關。除了基因測序,他們還將記錄參與測試者的微生物組(microbiome)和代謝(metabolome)數據,目標是把每個人的基因變體、自帶細菌組成、血液中的分子和他們的就診歷史聯系在一起。

       Venter認為通過數據分析不僅能夠發現一些慢性病的早期征兆,及時為每個人提供干預性治療,還能夠降低用藥成本。雖然HumanLongevity公司現在拿出來吸引眼球的技術看上去有些夸夸其談,但這些海量且多樣化的數據,本身就很有意義,至少我們可以預期在臨床方面能搞出一些亮點。Venter說,“這將是科學和醫藥界最大規模的研究數據之一。”好吧,這種說法你也很難去辯駁,而且Venter一貫如此。

       他還有一個特點就是和商業機構走的很近,“我們是一家商業機構,而且我們的事業得花不少錢,所以產生的數據一定要有商業價值。”Venter心目中的商業模式是以原始數據對外收費,但這也引起外界擔心,他們如何獲得匿名參與者和病患的書面同意。

       目前,公司和Moores癌癥中心合作,所有中心的病人如果不明確表示退出,則表示同意讓HumanLongevity為自己測序基因組,以及各種腫瘤數據。所有數據將被保存并用來尋找新的治療靶向,路徑和生物標記物。

       現在有兩組Illumina最新最強大的HiSeqXTen測序儀,公司已經成為注定成為基因研究的中心,而Venter決定為每一位接受測序者建立病例檔案的做法,即使不考慮與微生物和代謝數據的結合,也應該會有他提到的商業價值,就是不知道(我們只能希望)臨床價值來得沒那么晚。

把有關“下一代測序”的負面報道看做是暫時受挫的相關報道

任何顛覆,到“失控”之間,總難免遇到若干“文件風險”

       就在去年圣誕節購物季前夕,FDA發函禁止23andMe向消費者推銷99美元的基因測試產品。目前已經有50萬消費者選擇了這款產品,只需一根棉簽,你就可以更加詳細地了解你的祖輩,以及248項基因特性(比如某種特別的健康風險,某種藥物反應)和健康方面的信息。然而來自Wired(連線)雜志2014年1月點評:23andMe基因測試被叫停,輸的是與FDA這場戰役,而不會是整個基因測試戰爭。

       在FDA的指控中,將23andMe歸為診療設備一檔(意味著最為嚴格的監管),認為既然要被用作診斷,就必須在提供全面的研究數據作為支持的前提下獲得FDA批準后,才可向消費者推薦使用。函中指出最令人擔心的是消費者對這些基因信息的各種不正確反應,要么不夠,要么過度。一些消費者甚至會強迫醫生為自己做沒有必要的手術或者開藥。FDA認定對基因信息濫用產生的成本,會大于可能給消費者帶來的好處。

       而一些報道則顯示,當病人拿著基因數據去向自己的醫生咨詢時,醫生要么不懂得,要么不愿意,要么干脆抵制,因為醫生正是現有利益集團的一部分,面對醫患關系將要發生的顛覆性改變,他們必須掙扎。各種現有利益集團一起跑到監管者那里去告狀(以前也沒少發生,Uber,Lyft,Sidecar,Airbnb),只是這次是23andMe。

      公司已經向FDA服軟,保證不再提供除遺傳性數據以外的信息。或許未來公司會和FDA達成某種和解,若難以澆滅FDA怒火,這家新興的公司和這項技術可能帶來的價值都將告終。市場上不止是23andMe,而是已經涌現出一批監控、測試、感知的設備,讓消費者立等可知自己的健康、睡眠、攝取食物等生活方式是否正確等等。也許,未來監管者將受到來自消費者(巨大需求)和業內人士(新機遇帶來重新洗牌)的壓力。

       海量的基因數據的價值不僅在于改善健康,降低成本,還可以使醫療研究走上正軌,這有可能是繼二十世紀早期抗生素發現之后醫療健康領域最大的變革。未來不到100美元測試的可能就不只是幾百萬基因數據,而是全部。不管23andMe最終的命運怎樣,輸的將是認為自己能夠憑借阻擋趨勢從而贏得未來的那一方。

        隨著下一代基因組測序(next-generationDNAsequencing簡寫NGS)的代表Illumina將價格門檻大幅降低,測序速度大幅提高,現在科學家們研究基因就真的站在開放假說的基礎上,而不是像過去那樣,只能聚焦于基因組的“熱門”地方以求發現某些關鍵性突變。通俗的比喻就是,你在黑暗中找把鑰匙,用泛光燈總比拿手電筒成功的概率大。

       我們認為NGS最先的受益者是藥企,特別是癌癥藥物的藥企。以前我們都用病變的部位來定義癌癥,比如肺癌、乳腺癌、前列腺癌等等,現在越來越多的研究表明,應該從導致病變的基因路徑和突變入手,病變的身體部位只是“副產品”。很多一線的治療藥物不僅無效,甚至會產生副作用。有了NGS的發展,今后藥企的研發項目效率會大大提高,病人支付的藥費也會降低。瓶頸呢?兩個。生物信息學和監管。首先讓大家對行業發展速度有個概念,截止2013年底,總共完成測序50K基因組,而通過Illumina最新的HiSeqXTen設備,僅一組(10臺)一年就能完成18K基因組。主要參與各方會有大型實驗室Broad研究院(哈佛與MIT共同主持),藥企(已經表示的有Regeneron,Amgen),新的商業化實驗室(CraigVenter剛剛成立的HumanLongevity)。

       新技術帶來的海量基因數據,首先面對的就是缺少統一的行業標準,如何定義格式,質量,這些都將為之后的大規模商業化應用構成障礙。所以我們看到NGS價值鏈已經迅速倒向對生物信息學進行規模化解讀的軟件工具。好消息是Illumina,Google,Merck&Co,以及紐約基因中心,已經成立全球聯盟(GlobalAllianceforGenomicsandHealth),有助于形成基因學領域的產業標準。在眼下缺乏標準的情況下,為了獲得基因數據,加速研發新型治療方法(主要在腫瘤領域),藥企也是各想各的招。有的與實驗室和臨床診斷公司聯手(FoundationMedicine,FMI),有的通過并購等手段將外部資源引入,建立公司內部的實驗室(比如Amgen與deCODEGenetics)。

       NGS臨床應用的第二大瓶頸是監管的不確定性(滯后性)。Illumina的MiSeqDx拿到FDA臨床使用的批文后,使用此設備進行臨床診斷測試的機構還是需要選擇究竟是取得FDA的批文,還是走“捷徑”——算作實驗室開發試驗(lab-developed-test,LDT),放棄CLIA的批準(CLIA-waived),也不受FDA監管。

       后者已成為生殖健康和腫瘤基因測序領域可取的解決方案。但問題也出現了,雖不明顯但有加深的趨勢,即LDT對伴隨診斷(companiondiagnosticsCDx)帶來的競爭壓力。伴隨性診斷是與藥企合作,提高藥物研發的效率。目前CDx的市場主要針對個別基因突變,隨著NGS的發展,跨越不同基因路徑的突變會成為接下來CDx的更大潛在市場。

       CDx雖然得到官方認可,但FDA并沒有給出明確的監管條線,所以與監管明顯更松的LDT競爭優勢不明顯,一方面伴隨診斷的重要力量診斷公司投入的熱情會降低,另一方面保險公司面對不確定性也不愿支持,這樣診斷公司的投入很有可能無法收回。

       另外,前面提到過,未來新藥將基于基因路徑,而現有FDA批文仍主要基于突變部位,所以未來的研究找到對應的藥物可能沒有FDA認可,這已經在FMI(FoundationMedicine)上有所體現,病人治病要緊,醫生可能會被迫開出無FDA標記的藥物,而病人也將越來越多的面臨這種尷尬的選擇。

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